Tehran University Medical Journal

other نقش بیومارکری ژن‌های CH25H و GYPE در بیماری استئوآرتریت و روماتویید آرتریت Biomarker role of CH25H and GYPE genes in osteoarthritis and rheumatoid arthritis مقاله اصیل Original Article زمینه و هدف: استئوآرتریت و آرتریت روماتویید هر دو بیماری مفاصل هستند و همچنین علل بسیار متنوعی دارند. با توجه به رویکردهای درمانی متفاوت OA و RA، تشخیص دقیق نوع آرتریت بسیار مورد توجه است. مطالعه حاضر با هدف یافتن بیان ژن و معرفی بیومارکر مولکولی قابل اعتماد برای RA و OA انجام شد. روش بررسی: مجموعه داده‌های ریزآرایه به شماره GSE27390 به‌دست آمد. تجزیه و تحلیل بیان افتراقی بین گروه OA و RA با استفاده از GEO2R انجام شد و و ژن‌های دارای تفاوت بیان با بررسی دو فاکتور logFC#1 و 05/0P< جدا شدند. مسیرهای سیگنالینگ با استفاده از پایگاه‌های داده Enrichr تعیین شد. در ادامه ژن‌های دارای بیشترین تغییر بیان معرفی شد. این بررسی از نوع مطالعه بیوانفورماتیکی بوده و از تاریخ مهر 1401 تا فروردین 1402 به‌طور مشترک در دانشگاه علوم پزشکی بم و مرکز آموزشی تحقیقاتی و درمانی قلب و عروق شهید رجایی انجام شده است. یافته‌ها: در این بررسی نتایج نشان داد که 5083 ژن دارای تفاوت بیان معنادار بودند. تجزیه و تحلیل مسیرهای سیگنالینگ نشان داد که مسیرهای التهابی در این بیماری مهم بوده و همچنین مشخص شد که دو ژن CH25H و GYPE می‌تواند توانایی جداسازی روماتویید آرتریت را از استئوآرتریت داشته باشد. نتیجه‌گیری: در مجموع، داده‌های ما نشان داد که ژن ها می توانند به‌عنوان نشانگرهای زیستی جدید با سودمندی بالقوه در تشخیص RA و OA عمل کنند و به‌عنوان بیومارکرهای مولکولی جدید برای تشخیص این دو بیماری در نظر     گرفته شوند.   Background: Osteoarthritis (OA) and rheumatoid arthritis (RA) are both joint diseases with many different causes. Inflammatory arthritis, also known as rheumatoid arthritis, is one of the most complex types of arthritis. Non-inflammatory arthritis, also known as osteoarthritis, is a disease caused when the cartilage between the joints begins to be damaged. Considering the different treatment approaches for OA and RA, an accurate diagnosis of the type of arthritis is very important. The present study was conducted with the aim of finding gene expression and introducing reliable molecular biomarkers for RA and OA. Methods: The microarray dataset was obtained under the GSE27390 number. The samples included nine samples of mononuclear cells obtained from the bone marrow of RA patients, 10 samples of mononuclear cells obtained from the bone marrow of OA patients. Differential expression analysis between the OA and RA groups was performed using GEO2R, and genes with differential expression were separated by examining two factors such as logFC#1 and p.adj. Value<0.05. Signaling pathways were determined using Enrichr databases. Next, the genes with the most expression changes were introduced. This study is a bioinformatics analysis and was conducted jointly at Bam University of Medical Sciences and Rajaie Cardiovascular, Medical and Research Institute from September 2022 to March 2023. <div> <table align="center" hspace="0" vspace="0"> <tbody> <tr> <td align="left" style="padding-top:0in; padding-right:12px; padding-bottom:0in; padding-left:12px" valign="top">Results: The results showed that, 5083 genes had significant expression differences. Analysis of signaling pathways showed that antigen processing and presentation,  natural killer cell-mediated cytotoxicity, the, IL-17 signaling pathway, Th17 cell differentiation and cytokine-cytokine receptor interaction, as inflammatory pathways, were important in this disease. It was also determined that CH25H (upregulated in RA samples) and GYPE (downregulated in RA samples) genes can distinguish rheumatoid arthritis from osteoarthritis. Conclusion: Since accurate diagnosis helps with better disease treatment, it is very important to obtain new biological diagnostic markers. Overall, our data showed that genes can act as novel biomarkers with potential utility in the diagnosis of RA and OA and can be considered novel molecular biomarkers for the diagnosis of these two diseases. </td> </tr> </tbody> </table> </div> نشانگرهای زیستی, بیماری‌های مفصلی, استئوآرتریت, آرتریت روماتویید. biological marker, joint diseases, osteoarthritis, rheumatoid arthritis. 288 294 http://tumj.tums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3666-657&slc_lang=other&sid=1 Akram Gholipour اکرم قلی‌پور Yes Cardiogenetics Research Center, Rajaie Cardiovascular Medical and Research Center, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran. مرکز تحقیقات کاردیوژنتیک، مرکز آموزشی، تحقیقاتی و درمانی قلب و عروق شهید رجایی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران. Mahshid Malakootian مهشید ملکوتیان No Cardiogenetics Research Center, Rajaie Cardiovascular Medical and Research Center, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran. مرکز تحقیقات کاردیوژنتیک، مرکز آموزشی، تحقیقاتی و درمانی قلب و عروق شهید رجایی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران. Maziar Oveisee مازیار اویسی No Department of Orthopedics, Bam University of Medical Sciences, Bam, Iran. گروه ارتوپدی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی بم، بم، ایران.