<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Tehran University Medical Journal</title>
<title_fa>مجله دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران</title_fa>
<short_title>Tehran Univ Med J</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://tumj.tums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1683-1764</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>1735-7322</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.18869/acadpub.tumj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>000</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>000</journal_id_nlai>
<journal_id_science>000</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1387</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2008</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>66</volume>
<number>9</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی گونه‌های بیماری‌زای جنس کاندیدا: روش PCR-FSP</title_fa>
	<title>Identification of Pathogenic Candida Species: PCR-Fragment Size Polymorphism (PCR-FSP) Method</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa></content_type_fa>
	<content_type></content_type>
	<abstract_fa>
&lt;strong&gt;زمینه و هدف&lt;/strong&gt;: شناسایی کاندیداها از نظر تشخیصی، درمانی، اپیدمیولوژیک و بیولوژیک واجد اهمیت است. در این مطالعه رویکرد جدیدی از متدهای مبتنی بر DNA برای شناسایی کاندیداهای مهم پاتوژن استفاده شد و فقط با انجام واکنش PCR و بدون نیاز به روش‌های بعد از PCR گونه‌های مهم کاندیدا به‌سهولت از یکدیگر متمایز شدند.&lt;strong&gt;&lt;br&gt;روش بررسی: &lt;/strong&gt;این مطالعه، یک بررسی توصیفی- تجربی و نمونه‌های مورد آزمون شامل استرین‌های استاندارد و 60 ایزوله از بیماران بود. DNAی همه نمونه‌ها به‌روش glass-beads و فنل- کلروفرم استخراج و برای PCR از پرایمرهای ITS1، ITS2، ITS3 و ITS4 که دو قطعه ITS1 و ITS2 را تکثیر می‌نمایند استفاده شد. گونۀ مخمر با توجه به الگوی الکتروفورتیک حاصله و با در نظر گرفتن اندازه‌های به‌دست آمده از آنالیز سکانس‌ها تشخیص داده می‌شد.&lt;strong&gt; &lt;/strong&gt;  &lt;p dir=&quot;rtl&quot;&gt;&lt;strong&gt;یافته‌ها:&lt;/strong&gt; با بررسی کامپیوتری ده‌ها توالی مربوط به مخمرهای مختلف، مشخص شد که قطعات ITS1 و ITS2 در هر گونه مخمر اندازه مخصوصی دارند، لذا با تکثیر هر کدام از این قطعات و آنگاه اندازه‌گیری وزن آنها با الکتروفورز می‌توان هویت مخمرها را مشخص کرد. به‌روش فوق گونه‌های بیماری‌زای کاندیداها شامل آلبیکنس، تروپیکالیس، گلابراتا، پاراپسیلوزیس، کروزه‌ای، گیلیرموندی، کفیر، لوزیتانیا و روگوزا به روشنی قابل تشخیص گردیدند ولی افتراق کاندیدا آلبیکنس از کاندیدا دابلینینسیس با این روش میسر نبود. همه ایزوله‌های بالینی با این روش تشخیص داده شدند.&lt;/p&gt;  &lt;p dir=&quot;rtl&quot;&gt;&lt;strong&gt;نتیجه‌گیری: &lt;/strong&gt;در این مطالعه کارایی روشی ساده چه برای شناسایی استرین‌های مخمری استاندارد و چه برای شناسایی ایزوله‌های بالینی، نشان داده شد و به‌نظر می‌رسد که قابل توسعه برای تعیین هویت سایر مخمرها نیز می‌باشد.&lt;/p&gt;                                                                  
</abstract_fa>
	<abstract>
&lt;p style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background:&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt; &lt;/strong&gt;The clinical importance of yeast infections has increased in recent decades. There are 10-15 pathogenic Candida species. The current morphological and physiological methods for identification of Candida species are generally not easy to interpret and may be expensive or time-consuming. &lt;a name=&quot;IDADV2GK&quot;&gt;&lt;/a&gt;In the present study, we introduce and use a new approach for the identification and differentiation of medically important yeast species of Candida. In this method, size polymorphism of the internal transcribed spacer regions, ITS1 and ITS2, of the ribosomal DNA in various Candida species is used as the basis of species recognition.&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;Methods:&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt; &lt;/strong&gt;The genomic DNA of 31 standard strains and 60 clinical isolates was extracted and PCR-amplified using two primer pairs (ITS1-ITS2 and ITS3-ITS4) separately. Both PCR products were mixed and analyzed after standard agarose gel electrophoresis. The species of the tested yeasts were identified by the electrophoretic patterns of the mixed PCR products of each sample, comparing the data obtained from the sequence analyses of ITS1 and ITS2 molecules.&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt; &lt;/strong&gt;By this method, with the exception of C. albicans and C. dubliniensis, we were able to clearly differentiate nearly all common pathogenic Candida species, including C. albicans, C. glabrata, C. gulliermondii, C. parapsilosis, C. tropicalis,      C. krusei, C. kefyr, C. lusinaniae and C. rugosa. All standard and clinical strains were identified correctly, without expensive methods such as sequencing and capillary electrophoresis.&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;Conclusion: &lt;/strong&gt;It seems that the PCR-FSP method introduced in this study is the easiest molecular approach for the identification of a wide range of pathogenic Candida species and is applicable for diagnostic and epidemiological purposes in reference laboratories.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>PCR FSP،کاندیدا،شناسایی،ITS</keyword_fa>
	<keyword>PCR-FSP,candida,identification,ITS</keyword>
	<start_page>639</start_page>
	<end_page>645</end_page>
	<web_url>http://tumj.tums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-543&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mirhendi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>SH</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>میرهندی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Adin</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>H</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>آدین</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Shidfar</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>MR</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شیدفر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Kordbacheh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>P</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>پریوش</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کردبچه</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hashemi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>SJ</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید جمال</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>هاشمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Moazeni</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>M</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مریم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>موذنی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hosseinpur</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>L</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>لیلا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حسین‌پور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Rezaie Matehkolaie</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>A</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رضایی مته‌کلایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
