<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Tehran University Medical Journal</title>
<title_fa>مجله دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران</title_fa>
<short_title>Tehran Univ Med J</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://tumj.tums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1683-1764</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>1735-7322</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.18869/acadpub.tumj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>000</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>000</journal_id_nlai>
<journal_id_science>000</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1393</year>
	<month>2</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2014</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>72</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>ژنوتایپینگ گونه‌های بورخولدریا سپاسیه در بیماران سیستیک فیبروزیس به روش ژل الکتروفورز در میدان ضربانی</title_fa>
	<title>Identification of Burkholderia cepacia in patients with cystic fibrosis by pulsed-field gel electrophoresis</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa>مقاله اصیل</content_type_fa>
	<content_type>Original Article</content_type>
	<abstract_fa>زمینه و هدف: کمپلکس بورخولدریا سپاسیه یکی از عوامل مهم عفونت‌های جدی در بیماران مبتلا به فیبروز سیستیک است. هدف از این مطالعه، ژنوتایپینگ گونه‌های بورخولدریا سپاسیه در بیماران سیستیک فیبروزیس به روش Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) و نسبت تنوع گونه‌های کمپلکس بورخولدریا سپاسیه جدا شده از نمونه‌های بالینی بود. 
روش بررسی: در این مطالعه توصیفی، طی 12 ماه در سال 91-1390، 100 نمونه ترشحات ریوی از بیماران سیستیک فیبروزیس مراجعه‌کننده به بیمارستان مسیح دانشوری جمع‌آوری شد. پس از تلقیح نمونه‌ها بر روی محیط کشت Burkholderia Cepacia Selective Agar (BCSA) و انکوباسیون، کلنی‌های مشکوک جدا و با استفاده از تست‌های بیوشیمیایی و فنوتیپی شناسایی شدند. به منظور تایید بیش‌تر با روش لیز قلیایی، DNA باکتری استخراج و با Polymerase Chain Reaction (PCR) و بررسی ژن recA انجام شد. به منظور شناسایی پُلی‌مورفیسم و تنوع تایپی سویه‌های جدا شده بورخولدریا سپاسیه از الکتروفورز ضربان متناوب (PFGE) با استفاده از آنزیم با طیف اثر محدود (XbaI و SpeI) نیز استفاده شد.
یافته‌ها: از 100 نمونه مورد بررسی، پنج ایزوله به‌عنوان بورخولدریا سپاسیه شناسایی گردید. اطلاعات به‌دست آمده در الکتروفورز محصولات PCR و مقایسه باندهای ایجاد شده در نمونه‌های بیماران با سوش استاندارد ATCC 25416 بورخولدریا سپاسیه و مقایسه و آنالیز باندهای PFGE با سایز مارکر باکتری Salmonella choleraesuis سروتایپ Braenderup سویۀH9812 ، یکسان بود.
نتیجه‌گیری: وجود الگوی پالس تایپ مشابه در طول مطالعه موید این فرضیه است که عامل شناسایی شده در این مطالعه از یک منبع منتشر شده باشد. بنابراین فرضیه انتقال ارگانیسم فرد به فرد رد و ضرورت دارد که در مطالعات بعدی از منابع محیطی نمونه‌برداری شود.
</abstract_fa>
	<abstract>Background: Complex of Burkholderia cepacia is one of the main and serious causes of infections in cystic fibrosis patients that can be highly transmissible. Small hospital outbreaks are frequent and are usually due to a single contaminated environmental source. The pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) is widely used to identify the strain emission sources in cystic fibrosis patients. The aim of this research was to study genotyping of Burkholderia cepacia using PFGE method, and to evaluate diversity complex of clinical strains isolated from cystic fibrosis patients.
Methods: This is a descriptive study, in which 100 pulmonary secretion specimens of cystic fibrosis patients admitted in Masih Daneshvari Hospital, Tehran Iran in period of 12 months 2012 to 2013 were collected. The specimens were cultured on BCSA plate’s. After incubation suspected colonies were isolated and identified by biochemical and phenotypic method. All samples were checked by API system (API20NE) and by specific PCR method for genus Bulkhorderia and Bcc as well. DNA was extracted by alkaline lysis method and confirmed by PCR analysis of recA genes. Genetic diversity of isolate was performed by PFGE analysis according to Pulsenet guideline by using XbaI, SpeI as restriction enzyme which digests infrequently among the Burkholderia cepacia genome.
Results: Out of 100 samples five were identified as Burkholderia cepacia. It is obviously different at variously reports. The electrophoresis data of PCR products and comparison of band in samples from patients with standard strain ATCC 25416 Burkholderia cepacia and compare and analyse the PFGE size marker bands of Salmonella choleransuis serotype Braenderup H9812 strain, were the same.
Conclusion: Application of PFGE and identification of pulse-type is a potential tool to enhance the investigation of apparent nosocomial outbreaks of B.cepacia. Similar type of pulse patterns was observed in this study means that all of infection has been from one source therefore the hypothesis of transferring person to person will be rejected. Base on these results environmental sources sampling should be considered in future investigation.
</abstract>
	<keyword_fa>بورخولدریا سپاسیه, سیستیک فیبروزیس, الکتروفورز ضربان متناوب</keyword_fa>
	<keyword>burkholderia cepacia complex, cystic fibrosis, pulsed-field gel electrophoresis</keyword>
	<start_page>72</start_page>
	<end_page>78</end_page>
	<web_url>http://tumj.tums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-5193&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mohammad Mehdi </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Soltan Dallal</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد مهدی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سلطان دلال</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>soltanirad34@yahoo.com</email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Food Microbiology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran. Division Bacteriology, Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات میکروبیولوژی مواد غذایی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران. گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++.......................</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Celin </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Telefian </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سلین </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>تلفیان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Division Bacteriology, Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Massoud </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hajia </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مسعود </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حاجیا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Food Microbiology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.Iranian Reference Health Laboratory, Tehran, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات میکروبیولوژی مواد غذایی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران.  آزمایشگاه مرجع سلامت، وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی، ایران.  </affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Enayat </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kalantar </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عنایت </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کلانتر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Food Microbiology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.Department of Microbiology, School of Medicin, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات میکروبیولوژی مواد غذایی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران. گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali Reza </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dolatyar Dehkhar-ghani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علیرضا </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دولت یار دهخوارقانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Iranian Reference Health Laboratory, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa> آزمایشگاه مرجع سلامت، وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Abbas Rahimi Forushani </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name> Rahimi Forushani </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عباس </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رحیمی فروشانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه اپیدمیولوژی و آمار زیستی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Qamartaj </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Khanbabaei </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>قمرتاج </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>خان بابایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of. Pediatrics, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه اطفال، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mandana </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mobarhan </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ماندانا </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مبرهن</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Pediatric Respiratory Diseases Research Center, National Re-search Institute of Tuberculosis and Lung Diseases (NRITLD), Shahid Beheshti University of Medical Sci-ences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیماری‌های تنفسی کودکان، مرکز تحقیقات سل و بیماری‌های ریوی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Marjan </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Farzami </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مرجان </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فرزامی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Iranian Reference Health Laboratory, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa> آزمایشگاه مرجع سلامت، وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی، ایران. </affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
