fa بررسی ژن‌های مشترک سرطان پستان و چاقی به‌روش اولویت‌بندی ژن‌های کاندیدا مقاله اصیل Original Article <p>زمینه و هدف: گزارش‌های زیادی چاقی را به‌عنوان یک ریسک فاکتور مؤثر در ایجاد سرطان پستان تأًیید می‌کند، اما ارتباط مولکولی چاقی و سرطان پستان هنوز به درستی روشن نیست. مطالعه حاضر با هدف بررسی اولویت ژن‌های مؤثر در ارتباط مولکولی چاقی و سرطان پستان انجام شد. روش بررسی: این پژوهش از فروردین تا تیر 1393 در مرکز پژوهش‌های بیوشیمی و بیوفیزیک دانشگاه تهران به‌روش شبیه‌سازی رایانه‌ای برای الویت‌بندی ژن‌های مؤثر در ارتباط مولکولی چاقی و سرطان پستان انجام شد و از الگوریتم Multiple Data Sources برای تجزیه و تحلیل داده‌ها استفاده شد. ژن‌های آموزشی از میان ژن‌هایی انتخاب شد که تأثیر آنها در یکی از اختلالات چاقی و سرطان پستان و یا در هر دو، در مطالعات پیشین تأیید شده بود. دو دسته ژن کاندیدا وارد مطالعه شدند. گروه اول ژن‌هایی که در پنج ناحیه کروموزومی مشترک چاقی و سرطان پستان قرار داشتند و گروه دوم ژن‌های حاصل از آنالیز نتایج میکرواری پژوهش Creighton و همکاران بودند. یافته‌ها: تعداد 72 ژن حاصل آنالیز میکرواری و ژن‌های پنج ناحیه‌ی کروموزومی، به چهار سبک اولویت‌بندی شدند که از این میان پنج ژن NTRK3, TNFRSF10B, F2, IGFALS و HSP90B1 در 10 اولویت اول دو بار تکرار شده بود. این پنج ژن در ایجاد ارتباط مولکولی بین چاقی و سرطان پستان در اولویت قرار گرفتند. نتیجه‌گیری: وجود ژن‌های مشترک بین سرطان پستان و چاقی نشانگر وجود ارتباط مولکولی بین این دو موضوع می‌باشد. در این پژوهش امکان تأثیر پلی‌مورفیسم ژن F2 در ایجاد سرطان پستان همراه با ریسک فاکتور چاقی تأیید شد که در پژوهش‌های گذشته مطرح نشده بود.</p> <p>Background: Cancer and obesity are two major public health concerns. More than 12 million cases of cancer are reported annually. Many reports confirmed obesity as a risk factor for cancer. The molecular relationship between obesity and breast cancer has not been clear yet. The purpose of this study was to investigate priorities of effective genes in the molecular relationship between obesity and breast cancer. Methods: In this study, computer simulation method was used for prioritizing the genes that involved in the molecular links between obesity and breast cancer in laboratory of systems biology and bioinformatics (LBB), Tehran University, Tehran, Iran, from March to July 2014. In this study, ENDEAVOUR software was used for prioritizing the genes and integrating multiple data sources was used for data analysis. Training genes were selected from effective genes in obesity and/or breast cancer. Two groups of candidate genes were selected. The first group was included the existential genes in 5 common region chromosomes (between obesity and breast cancer) and the second group was included the results of genes microarray data analysis of research Creighton, et al (In 2012 on patients with breast cancer). The microarray data were analyzed with GER2 software (R online software on GEO website). Finally, both training and candidate genes were entered in ENDEAVOUR software package. Results: The candidate genes were prioritized to four style and five genes in ten of the first priorities were repeated twice. In other word, the outcome of prioritizing of 72 genes (Product of microarray data analysis) and genes of 5 common chromosome regions (Between obesity and breast cancer) showed, 5 genes (TNFRSF10B, F2, IGFALS, NTRK3 and HSP90B1) were the priorities in the molecular connection between obesity and breast cancer. Conclusion: There are some common genes between breast cancer and obesity. So, molecular relationship is confirmed. In this study the possible effect of gene F2 polymorphism in making breast cancer associated with obesity risk factor was confirmed, the fact that past studies have not been reported.</p> سرطان پستان, چاقی, ژن, شبیه‌سازی کامپیوتری breast neoplasms, computer simulation, genes, obesity 478 484 http://tumj.tums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-5370&slc_lang=fa&sid=1 Saba Garshasbi سبا گرشاسبی sabagarshasbi@ymail.com Yes Department of Biology, Islamic Azad University, Shahrekord Branch, Shahrekord, Iran. گروه زیست‌شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهرکرد Dariush Salimi داریوش سلیمی No Department of Bioinformatic, Laboratory of Systems Biology and Bioinformatics (LBB), Institute of Biochemistry and Biophysics, University of Tehran, Tehran, Iran. Department of Bioinformatic, Research Institute of ModernBiological Techniques (RIMBT), University of Zanjan, Zanjan, Iran. گروه بیوانفورماتیک، آزمایشگاه سیستم بیولوژی و بیوانفورماتیک، مرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک، دانشگاه تهران Abbas Doosti عباس دوستی No Biotechnology Research Center, Islamic Azad University, Shahrekord Branch, Shahrekord, Iran. مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهرکرد