<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Tehran University Medical Journal</title>
<title_fa>مجله دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران</title_fa>
<short_title>Tehran Univ Med J</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://tumj.tums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1683-1764</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>1735-7322</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.18869/acadpub.tumj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>000</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>000</journal_id_nlai>
<journal_id_science>000</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>75</volume>
<number>7</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی جهش‌های رایج ژن‌های KRAS و BRAF در بیماران مبتلا به کارسینومای بافت سنگ‌فرشی سر و گردن</title_fa>
	<title>Common mutations assay of KRAS and BRAF genes in patients affected with Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC)</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa>مقاله اصیل</content_type_fa>
	<content_type>Original Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:yekanyw;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt;زمینه و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt;کارسینومای بافت سنگ&#8204;فرشی (&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;Squamous cell carcinoma&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt;) سر و گردن، سرطان بافت اپیدرمی ناحیه&#8204;ی سر و گردن است. این عارضه شایعترین نوع سرطان&#8204;های سر و گردن (حدود ۹۰% موارد) است و همانند سایر بدخیمی&#8204;ها، جهش در ژن&#8204;های مسیر پیام&#8204;رسانی &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;RAS/MAPK&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; یا همان مسیر گیرنده فاکتور رشد اپیدرمی &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;(EGFR)&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt;، بسیار رایج است. از علل اصلی ابتلا به این سرطان&#8204;ها، جهش در ژن&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;KRAS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;BRAF&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; در بیش از (به&#8204;ترتیب) %۳۰ و ۱۰% موارد است. مطالعه&#8204;ی حاضر با هدف بررسی جهش&#8204;های شایع این دو ژن در ناحیه&#8204;ی سر و گردن انجام گردید.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt;روش بررسی: &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt;این پژوهش مقطعی-توصیفی از آبان ۱۳۹۲ تا شهریور ۱۳۹۵ بر کدون&#8204;های جهش&#8204;پذیر ۱۲ و ۱۳ اگزون ۲ ژن &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;KRAS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; و کدون &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;V600E&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; ژن &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;BRAF&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; در کارسینومای بافت سنگ&#8204;فرشی سر و گردن ۴۰ نمونه&#8204;ی تایید شده&#8204;ی مبتلا به این سرطان در بیمارستان امام خمینی (ره) تهران انجام شد و سه تکنیک استخراج &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; بر پایه فنل-کلروفرم،&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;Multiplex-PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; و آزمون استریپ در این پژوهش به&#8204;کار رفت.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt;در ۱۱ تن از بیماران جهش دو ژن &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;KRAS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;BRAF&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; به&#8204;میزان حدود ۱۷/۵% در ژن &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;KRAS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; (۱۰% جهش تبدیل گلایسین به آسپارتات و ۲/۵% جهش گلایسین به سرین در کدون ۱۲ و ۵% جهش تبدیل&#8204;کننده&#8204;ی گلایسین به آسپارتات در کدون ۱۳) و ۱۰% در ژن &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;BRAF&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; مشاهده شد. در یک بیمار نیز، همزمان، دو جهش در کدون ۱۲ مشاهده شد که نشان از ناهمگن بودن توده&#8204;ی سرطانی داشت.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری: &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt;با توجه به یافته&#8204;های به&#8204;دست آمده می&#8204;توان دو ژن &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;KRAS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 8pt;&quot;&gt;BRAF&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt; را در زمره&#8204;ی علل تاثیرگذار در ابتلا به سرطان سنگ&#8204;فرشی سر و گردن به حساب آورد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background: &lt;/strong&gt;Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) is the malignancy of squamous cells (the epidermal layer of skin) in cavities in head and neck includes: larynx, pharynx, paranasal sinuses and oral cavity. The main goal of this research was to understand the effect of mutations in two important genes (KRAS and BRAF) in RAS/MAP kinase (EGFR) signaling pathway in tumor cells with head and neck squamous cell carcinoma in Iran.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Methods: &lt;/strong&gt;The present cross-sectional study performed from October 2015 to September 2016 on 40 patients suffering from head and neck squamous cell carcinoma, all confirmed by pathology department of Imam Khomeini hospital. Tumor samples were achieved from the surgical cancer department of Imam Khomeini hospital and stored in liquid nitrogen until starting tests. The tests done in genetic laboratory of Tehran University of Medical Sciences. Techniques we used in this research, were DNA extraction based on phenol-chloroform approach, Multiplex PCR (M-PCR) to amplify mentioned exons and KRAS/BRAF strip assays to detect mutations in mutated hotspots in exon 2 of KRAS and codon V600E in BRAF gene.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results: &lt;/strong&gt;In this study, we observed 7 mutations in codons 12 and 13 exon 2 in KRAS gene (about 17.5%) and 4 mutations in codon V600E in BRAF gene (about 10%) of obtained tumor samples. The hotspot mutation in codon 12 were Asp (10%) and Ser (5%) respectively. In BRAF, the most common mutation, as we expected according to other researches, was observed in codon V600E. We also observed that 29 people of these patients were male (about 72.5%) and 11 patients were female (about 27.5%). Moreover, 28 patients were over 50 years, while 7 patients were below the age of 50.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion: &lt;/strong&gt;The results of this study showed that mutations in genes KRAS and BRAF especially in studied hotspots, and the effects on their molecules in EGFR signaling pathway are important in involving head and neck squamous cell carcinoma, as other cancers. These findings may be considered in choosing drugs for targeted chemotherapy.&lt;/div&gt;
&lt;div style=&quot;clear: both; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/div&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>ارزیابی بیولوژیکی, BRAF, پژوهش‌های مقطعی, سرطان اسکواموس سل سر و گردن, KRAS, جهش</keyword_fa>
	<keyword>biological assay, BRAF, cross-sectional studies, head and neck squamous cell carcinoma, KRAS, mutation</keyword>
	<start_page>490</start_page>
	<end_page>495</end_page>
	<web_url>http://tumj.tums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2547-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Razieh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zarifian Yeganeh </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>راضیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ظریفیان یگانه</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Genetics, School of Medicine, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Abbas</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shakoori Garakani </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عباس</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شکوری گرکانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>nooridaloii@sina.tums.ac.ir</email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Genetics, School of Medicine, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran. Genetic Laboratory, Cancer Institute, Imam Khomeini Hospital, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران. آزمایشگاه ژنتیک، انستیتو کنسر، بیمارستان امام خمینی (ره)، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Saman</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mehrabi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سامان</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مهرابی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Genetics, School of Medicine, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Nader</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ebadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نادر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عبادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Genetics, School of Medicine, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Maziar</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Motiee Langroudi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مازیار</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مطیعی لنگرودی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Surgery Center, Cancer Institute, Imam Khomeini Hospital, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز جراحی، انستیتو کنسر، بیمارستان امام خمینی (ره)، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad Reza </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Noori Daloii</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نوری دلویی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Genetics, School of Medicine, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
