Tehran University Medical Journal

other تایپینگ مولکولی سویه‌های اشریشیاکلی مقاوم به فلوروکینولون جدا‌سازی‌شده از بیماران تحت بیوپسی پروستات Molecular typing of fluoroquinolone resistant Escherichia coli isolates from patients undergoing prostate biopsy مقاله اصیل Original Article <div style="text-align: justify;">زمینه و هدف: باکتری اشریشیا کلی از مهمترین عوامل عفونی در بیماران تحت بیوپسی پروستات است. هدف از انجام پژوهش کنونی، تایپینگ مولکولی ایزوله‌های اشریشیاکلی کلونیزه مقاوم به فلوروکینولون و عفونت‌های ناشی از آن در بیماران تحت بیوپسی پروستات بود. روش بررسی: در این مطالعه کوهورت که از فروردین تا بهمن ۱۳۹۵ در مرکز تحقیقات ارولوژی بیمارستان سینا (تهران) انجام گردید، سواب‌های رکتال از ۱۵۸ بیمار مرد پیش از بیوپسی پروستات گردآوری شد. باکتری‌های گرم منفی مقاوم به سیپروفلوکساسین به‌همراه پس‌زمینه فیلوژنتیکی (با استفاده از روش Quadruplex PCR)، شیوع ST131 و ساب‌کلون‌های آن (H30 and H30-RX131) در دو گروه ایزوله‌های اشریشیاکلی کلونیزه و بالینی مورد مقایسه قرار گرفت. یافته‌ها: از مجموع، ۷۳ بیمار دارای کشت مثبت رکتال برای باکتری‌های گرم منفی مقاوم به فلوروکینولون بودند که غالب‌ترین ایزوله اشریشیاکلی بود. بیشترین ایزوله‌ها در گروه فیلوژنتیک B2 و به‌دنبال آن به‌ترتیب در گروه‌های A، E، C و D، B1 و F قرار داشتند. ایزوله‌های اشریشیاکلی مقاوم به فلوروکینولون، مقاومت سطح خیلی بالا به آمپی‌سیلین و تریمتوپریم- سولفامتوکسازول را از خود نشان دادند. به‌طور کلی، بیشتر ایزوله‌های اشریشیاکلی مقاوم به چندین آنتی‌بیوتیک در گروه B2 و با ژنوتایپ ST131 تشخیص داده شد. باوجود افزایش عفونت در میان بیماران کلونیزه با سویه E. coli ST131، تفاوت کمابیش معناداری در شیوع آن در بین دو گروه مشاهده شد (0/06P=). نتیجه‌گیری: پاتوژن ST131 شیوع بالایی را در کلونیزاسیون رکتال و عفونت‌های پس از بیوپسی پروستات داشت که مقاومت گسترده‌ای به آنتی‌بیوتیک‌های رایج را نشان داد.</div> <div style="text-align: justify;">Background: Escherichia coli (E. coli) is one of the most important infectious agents in patients undergoing prostate biopsy. It belongs to a large family of gram-negative rods, Enterobacteriaceae. This family includes members of the normal flora of the intestine that are only occasionally pathogenic. Recent considerations of rectal colonization with fluoroquinolone-resistant E. coli shows the need to change strategy of treatment of infection in patients undergoing prostate biopsy. Therefore, the purpose of this study was to determine molecular typing of fluoroquinolone resistant (FQR) E. coli rectal isolates and associated infections in patients undergoing prostate biopsy. Methods: In this prospective cohort study, rectal swabs were collected from 158 male patients before prostate biopsy at the Urology Research Center of Sina Hospital, Tehran, Iran, from March 2015 to February 2016. The FQR organisms were isolated using selective media, and antibiotic susceptibility pattern was determined for following antibiotics, ampicillin, levofloxacin, cotrimoxazole, amoxicillin-clavulanate, cefazolin, ceftazidime, cefepime, gentamicin, piperacillin-tazobactam, nitrofurantoin, amikacin, fosfomycin, imipenem. In general, phylogenetic background, prevalence of E. coli sequence type 131 (ST131) and its subclones (H30 and H30-Rx ST131) were compared in two groups of FQR E. coli rectal colonization and clinical isolates. Results: In total, 73 patients had a positive rectal culture for FQR gram-negative bacteria, the most prevalent isolate of which was E. coli. Phylogenetic group B2 was most predominant, followed by A, E, C and D, B1 and F. The antibiotic susceptibility patterns for the FQR organisms showed high levels of resistance to ampicillin and trimethoprim-sulfamethoxazole, while the resistance to amikacin, fosfomycin and imipenem remained very low. In general, antibiotic resistance to several antibiotic was mainly detected in group B2 and with ST131 genotype. Despite the increase in infections among patients colonized with strains of E. coli ST131, its frequency was almost statistically significant between colonized and infected groups. Conclusion: The ST131 pathogen has a high prevalence in rectal colonization and post prostate biopsy infections, which showed widespread resistance to common antibiotics.</div> بیوپسی, مقاومت دارویی, اشریشیاکلی, عفونت, پروستات biopsy, drug resistance, Escherichia coli, infection, prostate 629 636 http://tumj.tums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2000-4&slc_lang=other&sid=1 Amir Hasanzadeh امیر حسن‌زاده No Department of Microbiology, Maragheh University of Medical Sciences, Maragheh, Iran. Department of Pathobiology, School of Public Health and Biotechnology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran. گروه میکروب‌شناسی، دانشکده علوم پزشکی مراغه، مراغه، ایران. گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت و مرکز تحقیقات زیست فناوری، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران. Mohammad Reza Pourmand محمدرضا پورمند mpourmand@tums.ac.ir Yes Department of Pathobiology, School of Public Health and Biotechnology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran. گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت و مرکز تحقیقات زیست فناوری، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران. Shahram Gooran شهرام گوران No Urology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran. مرکز تحقیقات ارولوژی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران. Hasan Hosainzadegan حسن حسین‌زادگان No Department of Microbiology, Maragheh University of Medical Sciences, Maragheh, Iran. گروه میکروب‌شناسی، دانشکده علوم پزشکی مراغه، مراغه، ایران. Asghar Tanomand اصغر تنومند No Department of Microbiology, Maragheh University of Medical Sciences, Maragheh, Iran. گروه میکروب‌شناسی، دانشکده علوم پزشکی مراغه، مراغه، ایران. Gholamreza Pourmand غلامرضا پورمند No Urology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran. مرکز تحقیقات ارولوژی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران.